合同中说三个月不到就要扣500元。我现在三个月

扣500元是否合法需具体判断。根据《劳动合同法》，合同条款应合法合理。若扣款非法定或约定事由，则不合法。不及时处理可能导致权益受损，建议尽快协商或仲裁。
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扣500元需判断。操作建议：1.与单位沟通，说明情况，争取不扣款；2.若单位坚持扣款，查看合同及《劳动合同法》，确认扣款是否合法；3.如不合法，向劳动仲裁院申请仲裁，要求补发。
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对此类情况，常见处理方式为协商或仲裁。首先尝试与单位协商，解释辞职原因并争取不扣款。若协商无果，可向劳动仲裁院申请仲裁，依据《劳动合同法》维权。